Prima di iniziare, assicurarsi di avere eseguito il backup di tutti i file attualmente presenti sul sistema. Se sulla macchina è installato solo il sistema operativo nativo, con ogni probabilità sarà necessario ripartizionare il disco per liberare spazio per Debian GNU/Linux. Ogni volta che si ripartiziona il disco, si corre il rischio di perdere tutti i dati presenti, indipendentemente da quale programma utilizzato. I programmi usati durante l'installazione di Debian GNU/Linux sono piuttosto affidabili e la maggior parte sono in uso da anni, ma una mossa falsa può costare cara. Anche dopo aver fatto il backup, fare attenzione e valutare attentamente le scelte e le operazioni eseguite: dedicare qualche minuto in più alla verifica può evitare ore di lavoro inutile.

Se si sta creando un sistema a boot multiplo, assicurarsi di avere a portata di mano i supporti di installazione degli altri sistemi operativi. Anche se normalmente non è richiesto, potrebbe essere necessario reinstallare il boot loader del sistema operativo preesistente o, nel caso peggiore, reinstallare l'intero sistema operativo e ripristinare il backup dei dati fatto in precedenza.